摘要：Blast比对工具：利用序列相似性找到隐含在基因组中的信息 在生物学领域，基因序列的验证和功能注释是研究工作的基础。比对基因序列就是一个重要的步骤。Blast（Basic Local Align
Blast比对工具：利用序列相似性找到隐含在基因组中的信息
在生物学领域，基因序列的验证和功能注释是研究工作的基础。比对基因序列就是一个重要的步骤。Blast（Basic Local Alignment Search Tool）是一个专业的序列比对工具，具有广泛的应用领域。
1. Blast工具概述
Blast对生物序列的相似性比对包含两种：局部比对和全局比对。局部比对可在较快时间内查找目标序列中的特定区域，而全局比对则是比对整个序列。理解这两种比对方式有助于解释Blast的工作原理。在实际应用中，Blast通常是被用来确定一些特定的序列，而这些序列是仅隐含在广泛序列数据集合中。使用Blast，研究人员可以识别出序列是否已被发现，确定序列所对应的基因，预测变异和生物信息学研究领域的进化关系, 提供组学领域的宝贵信息，如序列起源、准确性、进化历程等。
2. Blast的基本使用方法
Blast工具是一款众所周知的免费app。通过它的聚合系统，用户可以上传基因序列后，就能立即获得许多有用的信息。Blast的使用方法包括以下几个步骤：
第一步是将待比对序列上传到Blast。用户可选择本地文件上传或在线制作。一旦成功上传了序列，Blast会自动执行相应的序列比对。
在第二个步骤中，用户需要根据个人需要指定比对条件参数。Blast提供了许多不同的选项，包括选择数据库类型，调整阈值，修改分数等参数。这些参数的选择与自我应用的特定情况和命中率有关。处理完这些选项后，用户只需等待Blast运算完毕即可。
第三步是查看Blast运算结果。Blast的输出主要是基于比对得分进行排序的，结果显示每个比对的基本信息。比对结果可以通过基因描述、位置、比对长度和匹配等参数来过滤和排序。一旦结果生成，用户可以选择将其保存到本地硬盘，以备后续研究。
3. Blast的应用场景
Blast可以应用于许多生物学领域的研究中。其常见应用方式可以归为以下四类：
1) 基因组数据筛选：Blast可以帮助研究人员从完整的基因组中筛选出所需要的基因序列。比如，在高含量基因组序列中可以快速精准识别出单个基因组序列，或定量分析一组基因组序列中存在的序列异质体和变异。
2) 生物信息的功能注释：Blast可以预测新的基因组DNA、RNA或蛋白质的功能。比对序列可以直接推断序列功能是否已经被发现。该应用还可以比对某个蛋白质序列中的单个关键功能位点，以发现这个功能位点与其他蛋白质存在的差异，从而预测突变是否会导致功能丧失。
3) 遗传学和生物学的进化分析：Blast用来比对DNA和RNA序列时，可以完整地比对和研究几十个个体或种群的序列变异。比对得分的分析还可以提供遗传变异和生物信息学进化分析的强有力支持。
4) Y基因导向的医疗筛选：Blast在医学领域的一大应用是进行基因变异的筛选。可以将新病例基因序列与已知的基因序列数据库进行比对，从而准确定位病人的基因突变类型和分布，对医药筛选产生重要提升。
Blast序列比对工具已成为重要的生物信息学工具，可用于帮助科学家决定细胞结构的功能。
